Indicatori molecolari delle variazioni della comunità batterica in suoli inquinati

Lo studio delle variazioni della struttura delle comunità batteriche presenti in tre suoli agrari, che hanno subito una forte pressione antropica, è stato condotto mediante tecniche di biologia molecolare. Il DNA di origine batterica è stato estratto dal suolo mediante la tecnica di estrazione diretta e quindi purificato per precipitazione con cloruro di cesio e filtrazione con colonnine cromatografiche. L'estratto nucleare purificato è stato quindi sottoposto ad amplificazione genica, mediante reazione a catena della polimerasi (PCR), di specifiche sequenze della regione genica 16S rDNA codificante per la sintesi dell'RNA ribosomiale (16S) della subunità piccola (30S) del ribosoma procariotico. L'analisi dei frammenti di amplificazione mediante la tecnica di separazione elettroforetica su gel di poliacrilammide con gradiente denaturante (DGGE) ha fornito dei profili molecolari con una distribuzione caratteristica di bande, ciascuna associabile ad una specie batterica, che nel complesso descrivono la struttura molecolare della comunità batterica del suolo.